
近日,南京市医科社会首个所属医院专家王学浩院土销售团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗能量消耗新陈代谢检测分析服务。
英语怎么说大标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
2英文标题格式:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
消费者机构:南京医科大学
学习涂料:细胞
拜谱提供数据服务培训:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向药物能量消耗产生组
科技途径:
的研究结杲
01、YBX1被鉴定结论为HCC中糖酵解的关键点基因遗传
本钻研提取HCC癌症样表(n=7)的单血受损细胞核RNA测序资料显示集开展定性研究,发现糖酵解活性氧关键汇聚在癌症血受损细胞核中,hdWGCNA定性研究辨别出9个基因遗传模块电源(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的环境定性研究选定YBX1为自己环境风险点要素(图1H)。进一个步骤根据IHC、WB检测和癌症企业结构与最靠近非癌症企业结构的的空间转录组学资料显示集表明YBX1是肝血受损细胞核癌控制的未知靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被来确定为调节器HCC癌细胞糖酵解的重点问题
02、YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法能量消耗分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1结合在一起并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1切合并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化不断增强其磷过酸,然后提高网站其核转位
进十步检则YBX1的O-GlcNAc糖基化能否作用其磷过酸,在OGT敲低的HCC人体血细胞中或用OGT促使剂OSMI-1加工工作,YBX1血清含量重要变低,YBX1磷过酸重要限制(图4A-C)。IP实验性展示,在相当的Flag-YBX1底物含量下,YBX1-WT的磷过酸含量重要要高于YBX1-T57A,呈现磷过酸的提升实际上仅是是由于比较高的YBX1血清表明(图4D)。隔离了核和质混合物得知TMG加工工作的HCC人体血细胞中YBX1核表明的提升(图4E-F),进十步得知YBX1磷过酸的最为关键的调理指数公式是AKT(图4G-I)。这样得知注重O-GlcNAc糖基化能够 驱动其磷过酸来增进YBX1血清平稳性并驱动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰重要于其进十步有磷硝化作用装饰并就能有利于促进其核转位
05、YBX1加速PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1可以淡化PKM2转录
06、YBX1 就能增进组淀粉酶乳硝化作用淡化含量
探究看到YBX1敲低正相关减小淀粉酶质乳酸性反应,更是是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解减缓剂2-DG的实践否认了糖酵解与组淀粉酶乳酸性反应的会立即关联性,减缓糖酵解可正相关减小H3K18la横向(图6D)。PKM2过展示不可逆转转YBX1敲低伴发的H3K18la变低,以外源乳酸补救不光升降H3K18la,还还会伴有YBX1展示上涨,提升产生正面反馈系统(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR否认,H3K18la在含有于YBX1起动子会立即有助于其转录,该历程受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),并看到P300 上涨是YBX1增强学习H3K18乳酰化为用的策略(图6K-L)。
图6.YBX1明显增强H3K18乳硝化作用绘制总体水平
内容个人总结
在此项设计中新闻了YBX1在HCC中高表述爱,因而与糖酵解谜切关联。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,可以不稳核氨基酸并增长其表述爱。本身突显还加速YBX1在T57处的磷碱化,加速其核易位。因而,该操作过程增強了糖酵解关联dna的转录并敏感乳酸的行成。因此,YBX1缴活P300的转录,从根本上带动组核蛋白质的乳碱化,尤为是H3K18la,H3K18乳碱化正在向自我调节YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因双面馈环原则图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法消耗的能量细胞代谢组技术服务,拜谱海洋生物建立了完善成熟的转录组学、蛋清组学、翻意后突显组学、分解组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
符合论文论文参考文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.